近日,Plant Biotechnology Journal(中科院一区Top,5年IF=12.4)杂志发表了由AC米兰官网农学院孙杰教授团队撰写的“pseudo-GhFAD2-1 is a lncRNA involved in regulating cottonseed oleic and linoleic acid ratios and seed size in Gossypium hirsutum”论文。该研究发现,源于棉花D亚基因组上GhFAD2-1的串联重复序列pseudo-GhFAD2-1(pGhFAD2-1)因剪接位点的改变使得pGhFAD2-1成为无蛋白质编码能力的 lncRNA。进一步,对pGhFAD2-1进行过表达、基因编辑敲除、互作蛋白鉴定及染色体可及性分析等,揭示了pGhFAD2-1在调控棉籽脂肪酸组分合成、籽粒大小等方面的新功能。

该研究解析了pGhFAD2-1与组蛋白去乙酰化酶 GhHDT1和40S核糖体蛋白GhRPS12相互作用,进而参与调控GhFAD2-1的表达水平,并影响了种子大小,为棉籽油品质和种子大小的遗传改良提供了新靶点和途径。此外,与人类和动物相比,植物lncRNA的研究尚处于起步阶段。与水稻和拟南芥不同,陆地棉的基因组是复杂的异源四倍体;解析lncRNA pGhFAD2-1的调控功能及网络,也有助于深入认识异源多倍体作物的基因表达与调控。
AC米兰官网农学院刘峰教授、孙杰教授、澳大利亚联邦科学与工业组织(CSIRO)农业与食品研究所Qian-Hao Zhu研究员为该研究工作共同通讯作者,博士生陈海虹为论文第一作者。
(通讯员:师晓东)
